A preliminary molecular epidemiologic study using analysis of variable number of tandem repeats of Acinetobacter baumannii OXA-23 producing strains isolated from hospitals in Rio de Janeiro State, Brazil
Revista Pan-Amazônica de Saúde (RPAS)
A preliminary molecular epidemiologic study using analysis of variable number of tandem repeats of Acinetobacter baumannii OXA-23 producing strains isolated from hospitals in Rio de Janeiro State, Brazil
Autor Correspondente: Viviane Zahner | [email protected]
Palavras-chave: Acinetobacter baumannii, VNTR, Public Health, Epidemiology
Resumos Cadastrados
Resumo Português:
A bactéria Gram-negativa Acinetobacter baumannii multirresistente (AbMR) constitui uma séria causa de infecções nosocominais em hospitais brasileiros. Um painel de 36 cepas, pertencentes a cinco genótipos pré-determinados poreletroforese em gel de campo pulsado (PFGE) de quatro diferentes hospitais na Cidade do Rio de Janeiro, Estado do Rio de Janeiro, Brasil, foi submetido à eletroforese em gel de agarose simples para determinar a variação de nove perfis de número variável de repetições em tandem (VNTR). Com base em dados publicados, os VNTR foram classificados em duas categorias, longa (L) e curta (C) repetições com diferentes implicações evolucionárias. Os resultados demonstraram a discriminação superior de VNTR sobre PFGE. O marcador VNTR Abaum_3002 era o menos discriminatório com apenas um alelo, enquanto VNTR10 e Abaum_2240, cada um, apresentaram quatro alelos. O uso da combinação de nove VNTR resultou em uma aperfeiçoada ferramenta de genotipagem que fornece relevantes informações epidemiológicas.
Resumo Inglês:
The Gram-negative multidrug-resistant (MDR) bacterium Acinetobacter baumannii constitutes a serious cause of nosocomial infections in Brazilian hospitals. A panel of 36 strains, belonging to five pre-determined pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) genotypes from four different hospitals in the City of Rio de Janeiro, Rio de Janeiro State, Brazil, was submitted to simple agarose gel electrophoresis to determine the variation of nine variable number tandem repeats (VNTR) band profiles. Based on published data VNTR were classified in two categories, long (L) and short (S) repeats with different evolutionary implications. The results demonstrated the superior discrimination of VNTR over PFGE. The VNTR Abaum_3002 marker was the least discriminatory with only one allele, while VNTR10 and Abaum_2240 each presented four alleles. The use of a combination of the nine VNTR resulted in a refined genotyping tool that provides valuable epidemiological information.
Resumo Espanhol:
La bacteria Gram negativa Acinetobacter baumannii multirresistente (AbMR) es una seria causa de infecciones nosocomiales en hospitales brasileños. Un panel de 36 cepas, pertenecientes a cinco genotipos predeterminados por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) de cuatro diferentes hospitales en la Ciudad de Rio de Janeiro, Estado de Rio de Janeiro, Brasil, fue sometido a electroforesis en gel de agarosa simple para determinar la variación de nueve perfiles de número variable de repeticiones en tándem (VNTR). Con base en datos publicados, los VNTR fueron clasificados en dos categorías, larga (L) y corta (C) repeticiones con distintas implicaciones evolutivas. Los resultados demostraron la discriminación superior de VNTR sobre PFGE. El marcador VNTR Abaum_3002 era el menos discriminatorio con un solo alelo apenas, mientras que VNTR10 y Abaum_2240, cada uno, presentaron cuatro alelos. El uso de la combinación de nueve VNTR resultó en una herramienta de genotipado perfeccionada que suministra relevantes informaciones epidemiológicas.
