Com o objetivo de estudar a flora das diatomáceas epilÃticas do Rio Pardinho, sul do Brasil, foram coletadas amostras de diatomáceas epilÃticas em cinco pontos de amostragem ao longo do rio durante um ciclo anual (agosto de 2001 a julho 2002). Foram identificadas 99 espécies, distribuÃdas em 23 famÃlias e 41 gêneros. As famÃlias mais representativas foram Naviculaceae (14 táxons), Gomphonemataceae (10) and Bacillariaceae (10). Os gêneros mais ricos em espécies foram Gomphonema Ehrenberg, Navicula Bory, Eunotia Ehrenberg and Nitzschia Hassal. Duas novas espécies são propostas (Nupela pardinhoensis Bes, Torgan & Ector and Surirella bouillonii Bes, Ector & Torgan). Além dos dados morfométricos de cada espécie, também são apresentadas 234 fotomicrografias em LM e MEV.