Amplification of the cap20 Pathogenicity Gene and Genetic Characterization Using Different Markers Molecular in Colletotrichum gloeosporioides Isolates

Ano: 2010 | Volume: 53 | Número: 6

Autores: Danielli Barreto Maciel, Lílian Vieira de Medeiros, Vivian Vieira de Medeiros, Mariele Porto Carneiro Leão, Luis Eduardo Aranha Camargo, Neiva Tinti de Oliveira

Palavras-chave: cap20 gene, colletotrichum gloeosporioides, pathogenicity

Resumo Português:

Estudos foram realizados para analisar a caracterização
genética usando marcadores de RFLP-ITS e ISSP e a
amplicação do gene de patogenicidade cap20 por PCR
em isolados de Colletotrichum gloeosporioides de
diferentes hospedeiros. Primers para o gene cap20
foram construídos a partir de seqüências selecionadas
do GenBank (National Center of Biotechnology
Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) com o
programa Primer 3. A análise dos dendrogramas
revelou que o marcador RFLP-ITS foi mais informativo
em separar as espécies de Colletotrichum, e que o
primer EI1 evidenciou maior diversidade genética. A
amplificação do DNA dos isolados de Colletotrichum
para o gene cap20 com os primers P1 e P2 indicou que
este gene pode apresentar variações dentro de C.
gloeosporioides relacionada ao hospedeiro, e que
também está presente em outras espécies de
Colletotrichum.

Resumo Inglês:

Studies were performed to analyze the genetic characterization using RFLP-ITS and Intron (primer EI1) markers
and the amplification of the cap20 pathogenicity gene by PCR in Colletotrichum gloeosporioides isolates of
different hosts plant. The genetic variability was accessed using RFLP-ITS and Intron markers and grouping by
UPGMA method. Primers to cap20 gene were constructed using selected sequences of the GenBank (National
Center of Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) with the Primer 3 program. The dendrograms
analysis showed that the RFLP-ITS marker was more informative to separate the Colletotrichum sp, and that primer
EI1 demonstrated greater genetic diversity. The amplification of the DNA of the Colletotrichum isolates to the
cap20 gene with primers P1 and P2 indicated that this gene could present variations into C. gloeosporioides related
with the host, and also that it was present in other Colletotrichum sp.