O modelo AMOVA ao estimar as variâncias nos diferentes nÃveis hierárquicos, verifica a homogeneidade de um conjunto de dados, identificando assim se esta variabilidade é estruturada entre grupos, subgrupos ou esta organizada dentro dos indivÃduos. Foram utilizados dados moleculares da região intergênica 16S e 23S do rDNA derivados da análise de ARDRA da amostra de 40 estirpes de rizóbio isolados de nódulos de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.), cultivados em solo ácido, com e sem calagem e fosfato natural. A estrutura hierárquica das 40 estirpes (indivÃduos) divide-se em tratamentos com e sem calagem (grupos: CC e SC), e dentro de cada tratamento a aplicação de uma ou duas doses de fosfato (subgrupos: P1 e P2). O trabalho foi divido em três partes: Verificação do nÃvel hierárquico de maior variabilidade; teste dos componentes de variância pelo método de reamostragem e identificação das estirpes com a maior divergência. Os resultados indicam que 85,4% da variabilidade total está no componente de variância , representado pelas 40 estirpes de rizóbio, e a técnica de agrupamento separou a amostra em dois tipos: estirpes com tratamento com calagem (CC) e sem calagem (SC).