Os sedimentos apresentam-se como um sistema complexo, que são afetados por parâmetros geológicos, hidrodinâmicos, quÃmicos e biológicos, caracterizado por uma interação entre o ambiente sedimentar de cada região. O presente estudo consistiu em caracterizar a diversidade de bactérias heterotróficas totais e fixadores de nitrogênio em sedimentos do rio Cuiabá utilizando técnicas convencionais de microbiologia e de biologia molecular. As amostras de sedimento foram coletadas com periodicidade bimestral, em quatro pontos sendo estes: Cuiabazinho, Passagem da Conceição, Ribeirão dos Cocais e Barão de Melgaço. As amostras foram processadas através de diluições seriadas (10-2 a 10-7) em solução salina 0,85%. Em seguida cultivadas em placa de Petri através da técnica de Spreed Plate, em meio de cultivo Trypic Soy Agar (TSA) para bactérias heterotróficas totais e para bactérias nitrificantes foram utilizados meios seletivos (NFB, JMV e Meio 79) incubadas a 35°C. Posteriormente as estirpes bacterianas foram reisoladas em Agar Nutriente (AN) a fim de obter cultura pura para análise morfotintorial de Gram. Este teste permitiu verificar que dos 202 isolados bacterianos, 59% eram bastonetes positivos, sendo que, a maior quantificação bacteriana obtida foi no meio de cultivo TSA, comparado aos outros meios de cultura. O perfil da comunidade bacteriana apresentou na sua maioria bactérias da famÃlia Bacillaceae com 28%, sendo que as mesmas foram utilizadas para a análise molecular por Box-PCR, que apresentou uma riqueza de espécies. Esses resultados indicam a importância de pesquisas sobre diversidade microbiana de sedimentos no Estado de Mato Grosso que utilizam técnicas moleculares.
Sediments are complex systems that are affected by geological, hydrodynamic, chemical and biological parameters, as determined by interactions between the sedimentary environments of each region. This study aimed to characterize the diversity of total heterotrophic bacteria and nitrogen fixers in Cuiabá River sediments using conventional techniques of microbiology and molecular biology. Sediment samples were collected bimonthly from four points: Cuiabazinho, Passagem da Conceição, Ribeirão Cocais and Barão de Melgaço. The samples were processed in serial dilutions (10-2 to 10-7) in 0.85% saline solution. They were then cultured in Petri dishes using the Spread Plate technique in the Trypic Soy Agar (TSA) culture medium for total heterotrophic bacteria and selective medium (NFB, JMV and culture median 79) incubated at 35°C for nitrifying bacteria. The bacterial strains were then re-isolated on Nutrient Agar (NA) in order to obtain a pure culture for the Gram analysis morphotypes. This test revealed that, of the 202 bacterial isolates, 59 % were positive rods. The largest bacterial count was obtained in the TSA medium, as compared to other means of culture. The profile of the bacterial community showed that most, or 28 %, of the bacteria were of the Bacillaceae family and these were used for molecular analysis using Box-PCR, which showed a great diversity of species. These results indicate the importance of microbial diversity research in sediments in Mato Grosso State using molecular techniques.
