Avaliação da transferibilidade de lócus de microssatélites em oito espécies de “Astyanax”

Evolução e Conservação da Biodiversidade

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ISSN: 22363866
Editor Chefe: Rubens Pazza
Início Publicação: 30/04/2010
Periodicidade: Anual
Área de Estudo: Biologia geral

Avaliação da transferibilidade de lócus de microssatélites em oito espécies de “Astyanax”

Ano: 2011 | Volume: 2 | Número: 1
Autores: Sabrina Alves da Silva, Pierre Rafael Penteado, Rubens Pazza, Karine Frenher Kavalco
Autor Correspondente: Sabrina Alves da Silva | [email protected]

Palavras-chave: microssatélites, amplificação cruzada, polimorfismo

Resumos Cadastrados

Resumo Português:

Os peixes do gênero Astyanax são popularmente conhecidos como lambaris ou piabas e são uns dos mais especiosos da região neotropical. Os microssatélites são um tipo de marcador molecular formado por arranjos de repetições em tandem de dois a seis nucleotídeos. São extremamente utilizados para identificação de indivíduos e no rastreamento da história biológica de populações, uma vez que normalmente geram padrões espécie-específicos. Este trabalho teve por objetivo verificar a amplificação cruzada utilizando seis pares de primers para lócus de microssatélites desenvolvidos a partir da espécie Astyanax mexicanus em outras espécies de Astyanax. Foram testadas quanto a transferibilidade de lócus oito espécies do gênero Astyanax. Para definir a melhor temperatura de anelamento de cada primer testes de amplificação foram realizados utilizando termociclador com gradiente de temperatura. Quatro primers amplificaram em pelo menos algumas espécies. Quatro espécies mostram padrão de amplificação positivo para um dos primers, apresentando um padrão bastante polimórfico.



Resumo Inglês:

The fish of the genus Astyanax are popularly known as lambaris or piabas and are one of the most specious of the Neotropics. Microsatellites are a type of molecular markerformed by arrangements of tandem repetitions up to six nucleotides. They are widely used for individual identification and tracking of the biological history of populations, since they typically generate species-specific patterns. This study aimed to verify the cross-amplification of primers for six microsatellite loci developed from Astyanax mexicanus in other Astyanax species. There were tested for the transferability of the loci eight species of Astyanax. Aiming to determine the best annealing temperature of each primer amplification, tests were performed using temperature gradient termocycler. We get amplification with four primer sets in at least some species. Four species shows positive amplification pattern for one primer, with a quite polymorphic pattern.