INTRODUÇÃO: O gênero Prevotella é constituído por bactéria gram-negativa anaeróbias com alta diversidade genética entre as espécies e pertence ao filo Bacteroidetes. O papel dos membros do gênero na microbiota intestinal e respiratória e seus efeitos ao hospedeiro não estão completamente elucidados tanto em indivíduos saudáveis como em fibrose cística (FC). Objetivo: O objetivo desse estudo foi analisar a prevalência de Prevotella spp. no microbioma intestinal e respiratório de crianças com FC e controles saudáveis, ao longo de um ano.
METODOLOGIA: Analisamos o sequenciamento do gene 16s rRNA de amostras fecais e de orofaringe aos 3, 6, 9 e 12 meses de idade de dez bebês com FC após diagnóstico por triagem neonatal (6 homozigotos e 4 heterozigotos para a mutação delF508) e cinco bebês controles saudáveis. O DNA foi obtido utilizando metodologia que se baseia na extração manual por beads magnéticas com protocolo desenvolvido internamente. (Neoprospecta Microbiome Technologies, Brasil) e o sequenciamento do microbioma realizado por sequenciamento de nova geração, na plataforma MiSeq (Illumina Inc., EUA), baseado na análise das regiões V3/V4 do gene 16S rRNA. As sequências foram analisadas por meio do pipeline Sentinel (Neoprospecta® Microbiome Technologies, Brasil).
RESULTADOS: Um total de 120 amostras (60 de fezes e 60 de orofaringe) foram coletadas regularmente a cada 3 meses, durante o período de um ano. Observou-se que a abundância de Prevotella spp., tanto nos controles saudáveis como em pacientes com FC, foi menor nas amostras de fezes em relação às amostras do trato respiratório superior. O filo Bacterioidetes na microbiota intestinal, foi mais abundante no grupo controle quando comparado ao grupo FC, vinculado, entretanto aos gêneros Bacteroides, Prevotella e Parabacteroides, respectivamente; sendo também observada uma relação inversa entre Prevotella spp e Bacteroides spp. Na microbiota respiratória, notou-se maior abundância do filo Bacteroidetes no grupo com FC em relação aos controles e, neste caso, com aumento proporcional do gênero Prevotella. A abundância de Prevotella spp. no microbioma intestinal não foi significativa entre os grupos, enquanto, nas amostras respiratórias estava aumentada ao longo do tempo, quando comparada aos controles saudáveis.
CONCLUSÃO: Amostras respiratórias apresentaram aumento de Prevotella spp. quando comparadas com amostras intestinais, tanto no grupo de controles saudáveis como no grupo com FC. Bactereoidetes apresentou diminuição significativa em todas as amostras fecais, dado esperado para a FC, por se tratar de um filo com efeito intestinal protetor. Há necessidade de novos estudos para entender o papel desse anaeróbio na inflamação relacionada à FC.
