Molecular characterization of G1 human rotaviruses detected in children from Belém, Pará, Brazil

Ano: 2010 | Volume: 1 | Número: 1

Autores: Luana da Silva Soares, Joana D'Arc Pereira Mascarenhas, Yvone Benchimol Gabbay, Rosa Helena Porto Gusmão, Alexandre da Costa Linhares

Palavras-chave: Gastroenteritis, Rotavirus Infections, Genetic Variation

Resumo Português:

Os rotavírus são responsáveis por 40% das ocorrências de gastroenterites infantil no mundo, resultando em 611 mil mortes anualmente, e o rotavírus do tipo G1 representa o seu genótipo circulante mais comum. O objetivo do presente artigo foi realizar a caracterização molecular das amostras de rotavírus do tipo G1 obtidas de crianças que participaram de estudos anteriormente conduzidos na Cidade de Belém, norte do Brasil, por um período de 21 anos (1982 a 2003). O rotavírus do tipo G1 foi detectado por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida, ensaio imunoenzimático (EIA) e reação em cadeia da polimerase precedida da transcrição reversa para os genes VP7 e VP4. Dos 798 espécimes positivos para rotavírus, 330 (41%) apresentavam especificidade G1 por EIA, usando anticorpos monoclonais. Um total de 148 amostras do tipo G1 foram analisadas por meio da reação em cadeia da polimerase precedida da transcrição reversa. A caracterização dos eletroferotipos e genótipos P dos rotavírus do tipo G1 ocorreu em frequências de 78% e 88%, respectivamente. Três variedades de eletroferotipos longos foram identificados, sendo L1 a predominante (79%). A combinação G1P[8] foi a mais frequente, responsável por 64% dos casos. As infecções mistas G1P[6]+P[8], G1P[4]+P[8], G1P[4]+P[6] e G1P[4]+P[6]+P[8] foram encontradas em 11 (7%), 11 (7%), 3 (2%) e 1 (0,6%) amostras, respectivamente. Uma amostra apresentando infecção mista G1+G4 foi identificada. Ressalte-se que este é o primeiro estudo a abordar a caracterização molecular de rotavírus do tipo G1 no Brasil. Nossos achados permitirão melhor compreensão a respeito da diversidade molecular associada às infecções por rotavírus do tipo G1 em nossa região.

Resumo Inglês:

Rotavirus is responsible for 40% of gastroenteritis infections worldwide, resulting in 611 thousand deaths annually among infants and young children. The aim of the present study was to perform molecular characterization of strains of the most common circulating rotavirus genotype (G1), which was obtained from children participating in studies previously conducted in Belém, northern Brazil over a 21-year period (1982 to 2003). G1 type rotavirus was detected by polyacrylamide gel electrophoresis, enzyme immunoassay and by reverse transcription polymerase chain reaction for the VP7 and VP4 genes. Of 798 specimens that were found to be positive for rotavirus, 330 (41%) had G1-specificity by EIA using monoclonal antibodies. A total of 148 G1 strains were analyzed by reverse transcription polymerase chain reaction. Electropherotypes and P genotypes characterization of G1 rotavirus occurred at frequencies of 78% and 88%, respectively. Three long electropherotype varieties were identified, with the L1 variety the most frequently found (79%). The G1P[8] combination was the most frequent, responsible for 64% of cases. Mixed infections of G1P[6]+P[8], G1P[4]+P[8], G1P[4]+P[6] and G1P[4]+P[6]+P[8] were found in 11 (7%), 11 (7%), 3 (2%) and 1 (0.6%) samples, respectively. One sample displaying a mixed G1+G4 infection was found. To our knowledge, this is the first study to focus on G1 rotavirus molecular characterization in Brazil. Our findings provide information that will allow a better understanding of the molecular diversity of G1 rotavirus infections in our region.

Resumo Espanhol:

Los rotavirus son responsables por 40% de los casos de gastroenteritis infantil en el mundo, con más de 611 mil muertes al año, y el rotavirus tipo G1 representa su genotipo mas común en circulación. El objetivo de este trabajo fue realizar la caracterización molecular de las muestras de rotavirus de tipo G1 obtenido en niños que participaron en estudios realizados anteriormente en Belém, ciudad situada en el norte de Brasil, durante un período de 21 años (1982 a 2003). El rotavirus de tipo G1 fue detectado por electroforesis en gel de poliacrilamida, e inmunoensayo enzimático (IEE), y por la reacción en cadena de la polimerasa precedida por transcriptasa inversa para los genes VP7 y VP4. De las 798 especies positivas para rotavirus, 330 (41%) presentaron especificidad G1 por IEE, usando anticuerpos monoclonales. Se analizó mediante la reacción en cadena de la polimerasa precedida de trascripción inversa un total de 148 cepas de tipo G1. La caracterización de genotipos P y electroferotipos de rotavirus de tipo G1 se produjo en las frecuencias de 78% y 88%, respectivamente. Se identificaron tres variedades de electroferotipos largos, siendo el L1 predominante (79%). La combinación G1P [8] fue el más frecuente, representando el 64% de los casos. Las infecciones mixtas G1P[6]+P[8], G1P[4]+P[8], G1P[4]+P[6] y G1P[4]+P[6]+P[8] fueron encontradas en 11 (7%), 11 (7%), 3 (2%) y 1 (0,6%) de las muestras, respectivamente. Se identificó una muestra que presentaba una infección mixta G1+G4. Cabe señalar que este es el primer estudio que analiza la caracterización molecular del rotavirus tipo G1 en Brasil. Nuestros hallazgos harán posible una mejor comprensión de la diversidad molecular asociada a la infección por rotavirus de tipo G1 en nuestra región.