O objetivo deste artigo é investigar se a natureza da fonte de financiamento influencia na interação universidade-empresa no Brasil em termos dos modos de interação e da motivação para a colaboração. Para tanto, utilizou-se uma base de dados que envolve 319 questionários respondidos pelos responsáveis pelas atividades de pesquisa e desenvolvimento e/ou pelas interações com universidades e institutos públicos de pesquisa (IPPs) em empresas localizadas no Brasil, que apresentaram interação com grupos de pesquisa de universidades/IPPs. São analisadas as empresas que financiaram com recursos próprios os projetos em colaboração com universidades/IPPs, num total de 135, e aquelas que financiaram a interação com uma composição de fontes privadas e públicas, totalizando 94. As análises apontam que a natureza do financiamento parece não influenciar nos modos de interação, mas sim nos objetivos (ou motivação) da cooperação entre empresas e universidades/IPPs.