Os peixes são os vertebrados de maior variação genética conhecida, com aproximadamente 20.000 espécies descritas. Os peixes de água doce são responsáveis por 20 a 25% da biodiversidade de vertebrados, no entanto, um percentual de 30 a 40% de toda a diversidade existente na ictiofauna neotropical não foi reconhecida. Dentro da famÃlia Loricariidae, particularmente no gênero Hypostomus, há uma grande similaridade morfológica entre os espécimes, o que dificulta sua identificação e o estabelecimento de relações filogenéticas entre as espécies. Na bacia do rio Paraná, incluindo o rio IvaÃ, há mais de 16 espécies de Hypostomus que não apresentam um consenso em relação a sua taxonomia. As técnicas baseadas em marcadores moleculares têm sido utilizadas na identificação de espécies de peixes neotropicais, entre elas se destacando a técnica do rDNA 5S. Este trabalho objetivou padronizar condições ideais de amplificação da técnica rDNA 5S para obter marcadores moleculares que possam ser utilizados para a identificação de espécimes de Hypostomus. Foi possÃvel realizar a amplificação de fragmentos de DNA pela técnica de rDNA 5S para Hypostomus, utilizando DNA em uma concentração de 5ng e em temperaturas de desnaturação de 92°C, anelamento de 40°C e extensão de 72°C. Assim, esta técnica poderá ser utilizada em futuros estudos de variabilidade genética desta espécie através desses marcadores moleculares.
Fish are the most diverse vertebrates, with nearly 20,000 described species. Although freshwater fish make up between 20 and 25% of vertebrate biodiversity, between 30 and 40% of all the diversity in neotropical ichthyofauna has not been described. Since the family Loricariidae, particularly the genus Hypostomus, comprises great morphological similarity between the specimens, their identification and the establishment of phylogenetic relationships among species are complex. There is no taxonomic consensus on more than 16 species of Hypostomus in the Paraná river basin, including the Ivaà river. Molecular markers techniques, especially 5S rDNA, have been used in the identification of neotropical fish species. Current study standardizes optimal conditions for the amplification of 5S rDNA technique to obtain molecular markers that may be used to identify Hypostomus specimens. The amplification of DNA fragments from Hypostomus by 5S rDNA, using DNA in a concentration of 5ng and denaturing temperatures of 92°C, annealing at 40° C and extension at 72°C was achieved. Results show that the above technique may be used in future studies on genetic variability of this species using molecular markers.