Production of DNA Microarray and Expression Analysis of Genes from Xylella fastidiosa in Different Culture Media

Brazilian Archives Of Biology And Technology

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Curitiba / PR
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Site: http://www.scielo.br/babt
Telefone: (41) 3316-3012
ISSN: 15168913
Editor Chefe: Carlos Ricardo Soccol
Início Publicação: 30/11/1946
Periodicidade: Bimestral
Área de Estudo: Biologia geral

Production of DNA Microarray and Expression Analysis of Genes from Xylella fastidiosa in Different Culture Media

Ano: 2009 | Volume: 52 | Número: 3
Autores: Regiane de Fátima Travensolo, Maria Vitória Cecchette Gottardi Costa, Lucia Maria Carareto-Alves, Emanuel Carrilho, Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
Autor Correspondente: Regiane de Fátima Travensolo | [email protected]

Palavras-chave: dna microarray, xylella fastidiosa, expression, expression, transcriptome

Resumos Cadastrados

Resumo Português:

DNA Microarray foi desenvolvida para monitorar
a expressão de muitos genes de Xylella fastidiosa,
permitindo a comparação de duas situações
distintas em um único experimento. Os
experimentos foram feitos utilizando células de X.
fastidiosa cultivada em dois meios de cultura:
BCYE e XDM2. Pares de oligonucleotídeos
iniciadores foram sintetizados, depositados em
lâminas de vidro e o arranjo foi hibridizado contra
cDNAs marcados fluorescentemente. Os sinais
emitidos foram quantificados, normalizados e os
dados foram estatisticamente analisados para
verificar os genes diferencialmente expressos. De
acordo com nossos dados, 104 genes foram
diferencialmente expressos para o meio de cultura
XDM2 e 30 genes para o BCYE. No presente
estudo, nós demonstramos que a técnica de DNA
microarrays eficientemente diferencia genes
expressos sob diferentes condições de cultivo.



Resumo Inglês:

DNA Microarray was developed to monitor the expression of many genes from Xylella fastidiosa, allowing the sideby-
side comparison of two situations in a single experiment. The experiments were performed using X. fastidiosa
cells grown in two culture media: BCYE and XDM2. The primers were synthesized, spotted onto glass slides and the
array was hybridized against fluorescently labeled cDNAs. The emitted signals were quantified, normalized and the
data were statistically analyzed to verify the differentially expressed genes. According to the data, 104 genes were
differentially expressed in XDM2 and 30 genes in BCYE media. The present study showed that DNA microarray
technique efficiently differentiate the expressed genes under different conditions.