O estuário é um importante local de alimentação e repouso para bandos mistos de aves. Por esse motivo,observações diárias foram feitas no Baixio do Boguaçu, na Ilha Comprida, em duas campanhas durantea maré de quadratura e de sizÃgia, no mês de janeiro de 2007. Os resultados mostram a presença, dentre2.151 aves observadas, de 14 espécies, das quais 46,95% pertenceram à espécie Phalacrocorax brasilianus,20,41% à Egretta caerulea e 17,01% à Fregata magnifi cens. O Ãndice de diversidade de Shannon variou entre1,6128 e 0,8421, enquanto o Ãndice de equitabilidade de Pielou oscilou entre 0,649 e 0,523. Comparadasà s variações na amplitude da maré, a riqueza e a abundância total de espécies apresentaram correlaçõesnegativas de 0,557 e 0,4281, respectivamente, no Baixio do Boguaçu. As espécies que apresentarammaiores valores de correlação com as variações no nÃvel médio do mar foram: Egretta caerulea (0,6955),Platalea ajaja (0,646), Ardea cocoi (0,4756), Larus dominicanus (0,3033), Ardea alba (0,2245), Calidris fuscicollis(0,2101) e Eudocimus ruber (0,1786).
