Os coronavírus humanos (CoVh) são responsáveis por ocasionar doenças respiratórias e entéricas, sendo associados às infecções agudas e graves do trato respiratório. O objetivo deste trabalho foi identificar a ocorrência dos CoVh em pacientes com infecção respiratória aguda (IRA) na Cidade de Belém, Estado do Pará, Brasil, atendidas pelo programa de vigilância do vírus da influenza do Instituto Evandro Chagas. No período compreendido entre agosto de 2009 a março de 2011, amostras de aspirado da nasofaringe ou swab combinado (nasal e oral) obtidas de 308 pacientes com diagnóstico clínico de IRA, foram laboratorialmente investigadas na busca de evidências de infecção pelo CoVh. A metodologia adotada envolveu quatro etapas principais: a) extração do RNA viral (RNAv) do espécime clínico; b) execução da técnica de reação em cadeia mediada pela polimerase precedida de transcrição reversa (RT-PCR); c) eletroforese em gel de agarose dos produtos gerados; e d) sequenciamento genético de nucleotídeos. O processamento laboratorial de todos os espécimes revelou positividade para CoVh em uma amostra clínica dos pacientes investigados. A análise filogenética da amostra positiva permitiu lassificá-la como pertencente ao subtipo OC43 de CoVh. O presente achado representa a primeira comprovação laboratorial da circulação deste agente viral na Região Amazônica. Estudos adicionais são necessários para um maior conhecimento da etiologia e epidemiologia deste agente viral em casos de IRA que ocorrem na Região Norte do Brasil.
Human coronaviruses (HCoVs) are responsible for causing respiratory and enteric diseases associated with severe acute respiratory tract infections. The aim of this study was to identify the occurrence of HCoVs in patients with acute respiratory infection (ARI) in Belém, Pará State, Brazil, assisted by the surveillance program of influenza viruses of Instituto Evandro Chagas. From August 2009 to March 2011, samples of nasopharyngeal aspirate or nasal and oral swabs obtained from 308 patients with clinical diagnosis of ARI were investigated in the laboratory in order to identify the HCoVs infection. The methodology involved four main steps: a) viral RNA (RNAV) extracted from the clinical specimen; b) application of reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR); agarose electrophoresis gel of the generated products; and d) DNA sequencing. The laboratory processing of all specimens were positive for HCoVs in a clinical sample of patients investigated. The positive sample was classified as belonging to the subtype OC43 of HCoVs by using the phylogenetic analysis. This finding represents the first laboratory confirmation of this viral agent circulation in the Amazon Region. Additional studies are needed for a better understanding of the etiology and epidemiology of this viral agent in cases of ARI occurring in Northern Brazil.
Los coronavirus humanos (CoVh) son los responsables por ocasionar enfermedades respiratorias y entéricas, siendo asociados a las infecciones agudas y graves del trato respiratorio. El objetivo de este trabajo fue el de identificar los episodios de CoVh en pacientes con infección respiratoria aguda (IRA) en la Ciudad de Belém, en el Estado de Pará, Brasil, atendidas por el programa de vigilancia del virus influenza del Instituto Evandro Chagas. En el período comprendido entre agosto de 2009 a marzo de 2011, muestras de aspirado nasofaríngeo o frotis combinado (nasal y oral) obtenidas de 308 pacientes con diagnóstico clínico de IRA, fueron investigadas en laboratorio a la búsqueda de evidencias de infección por CoVh. La metodología adoptada abarcó cuatro etapas principales: a) extracción del RNA viral (RNAv) del espécimen clínico; b) ejecución de la técnica de reacción en cadena mediada por la polimerasa recedida de transcripción reversa (RT-PCR); c) electroforesis en gel de agarosa de los productos generados; y d) secuenciación genética de nucleótidos. El procesamiento de laboratorio de todos los especímenes se reveló positivo para CoVh en una muestra clínica de los pacientes investigados. El análisis filogenético de la muestra positiva permitió clasificarla como perteneciente al subtipo OC43 de CoVh. El presente hallazgo representa la primera comprobación en laboratorio de la circulación de este agente viral en la Región Amazónica. Son necesarios estudios adicionales para un mayor conocimiento de la etiología y la epidemiología de este agente viral en casos de IRA que ocurren en la Región Norte de Brasil.
