Este trabalho tem como objetivo central organizar uma discussão sobre como a lei 5.540/68 e a reforma universitária dos anos 90 atingiram diretamente o contexto da formação reflexiva de professores e, por conseguinte, o trabalho docente em sua prática cotidiana. Para tanto, apresentamos também uma análise sobre os pontos mais relevantes dessa reforma – a avaliação, a autonomia e o regime político das universidades e faculdades – na perspectiva de discutirmos o ensino e a pesquisa.