Dentro do ensino de química orgânica, o conceito de isomeria é de suma importância, já que está presente no nosso cotidiano. No entanto esse assunto é um dos mais difíceis para a compreensão dos alunos. O processo de ensino-aprendizagem em química orgânica enfrenta alguns obstáculos como aulas expositivas sem contextualização com o cotidiano do aluno, ensino baseado em memorização de nomenclaturas e fórmulas de compostos orgânicos, tornando a química ainda mais abstrata para o aluno. Considerando-se que a química é uma ciência bastante visual, o uso de representações visuais como modelos moleculares pode ser uma ótima estratégia de ensino, uma vez que auxilia na visualização tridimensional de moléculas, tornando-as mais acessíveis para a compreensão dos conceitos de isomeria, no qual utiliza-se muito a habilidade visual para distinguir os compostos isômeros. Há uma variedade de modelos moleculares que podem ser empregados no ensino de química como modelos comerciais, modelos construídos com materiais de baixo custo e modelos computacionais, por exemplo. Cabe o professor empregar o modelo mais apropriado para tornar a aprendizagem significativa para o aluno. Os modelos moleculares se mostram aliados no processo de ensino-aprendizagem que podem contribuir positivamente para a compreensão dos conceitos de isomeria pelos alunos.