Os Mestrados Profissionais em Ensino de Ciências (MPEC) ocupam espaço relevante no conjunto de iniciativas de Formação Continuada de Professores na área de Ciências da Natureza. Passadas duas décadas de sua criação, ainda são centrais nos debates educacionais. De modo a contribuir com tais discussões, realizamos uma metassíntese através da análise de conteúdo de asserções de valor (críticas, receios, apreciações e expectativas) sobre aspectos dos MPEC expressos em artigos científicos e editoriais, publicados entre 2002 e 2022 em periódicos classificados no Sistema Qualis/Periódicos nos estratos A1, A2 e A3 (2013–2016) e A1 e A2 (2017–2020). Organizamos os resultados em torno dos seguintes aspectos dos MPEC: Currículo e Ensino; Pesquisa Científica; e Produção Científica. Entre outros elementos, destacam-se discussões sobre asserções de valor positivas, como a indissociabilidade entre prática profissional e formação, e negativas, como a dificuldade na difusão de produtos e/ou processos educacionais. As asserções de valor identificadas em nossa investigação permitem subsidiar debates sobre a modalidade, qualificando posicionamentos e orientando potenciais pesquisas sobre os MPEC.